Ez egy felsővezetői pozíció, amely egy olyan, szakemberekből álló multidiszciplináris csoport vezetésére szolgál, amely az Európai Unió jövője szempontjából kulcsfontosságú prioritási terület támogatására hívta fel a figyelmet. Az ügyvezető igazgató felelős a kompetenciaközpont működéséért, napi ügyvezetéséért, és ő a kompetenciaközpont törvényes képviselője. Az ügyvezető igazgató az igazgatótanácsnak tartozik elszámolással, és a rá ruházott hatáskörön belül teljes mértékben független módon végzi feladatát. Az ügyvezető igazgatót a kompetenciaközpont személyzete támogatja.
