Tai vyresniojo vadovo pareigos vadovauti įvairių sričių specialistų grupei, pakviestai remti svarbiausią prioritetinę Europos Sąjungos ateities sritį. Vykdomasis direktorius atsako už kasdienį Centro valdymą bei jo operacijas ir yra jo teisinis atstovas. Vykdomasis direktorius yra atskaitingas valdybai ir savo pareigas vykdo visiškai nepriklausomai, neviršydamas jam suteiktų įgaliojimų. Vykdomajam direktoriui padeda Centro darbuotojai.
