See on tippjuht, kes juhib valdkondadevahelist spetsialistide rühma, kes peab toetama üht Euroopa Liidu tuleviku prioriteetset valdkonda. Tegevdirektor vastutab keskuse tegevuse ja igapäevase juhtimise eest ning on selle seaduslik esindaja. Tegevdirektor annab aru keskuse nõukogule ja täidab oma tööülesandeid talle antud volituste piires täiesti sõltumatult. Tegevdirektorit toetavad keskuse töötajad.
