To je funkcija višeg rukovoditelja za vođenje multidisciplinarnog tima stručnjaka zaduženog za potporu ključnom prioritetnom području za budućnost Europske unije. Izvršni direktor odgovoran je za rad i svakodnevno upravljanje Centrom te je njegov pravni zastupnik. Izvršni direktor odgovara Upravnom odboru i obavlja svoje dužnosti potpuno neovisno u okviru ovlasti koje su mu dodijeljene. Izvršnog direktora podupire osoblje Centra.
